Divisiones coloniales y el crecimiento de la esclavitud en Puerto Rico
En 1514, la Corona española dividió Puerto Rico en dos distritos administrativos: el Partido de San Germán en el oeste y el Partido de San Juan en el este, separados por una línea que iba desde el río Camuy en el norte hasta el río Jacaguas en el sur. En los siglos siguientes, San Germán se subdividió en numerosos pueblos —incluidos Aguada, Añasco, Mayagüez, San Sebastián, Ponce, Rincón, Cabo Rojo, Moca, Aguadilla y otros—, algunos de los cuales luego se fusionaron, se dividieron y finalmente se convirtieron en municipios separados, como en el caso de Guánica.

La primera fuerza laboral rural estuvo compuesta por personas indígenas esclavizadas, que murieron en grandes cantidades, especialmente a causa de enfermedades infecciosas. Para reemplazar esta mano de obra, los españoles comenzaron a traer hombres, mujeres y niños esclavizados de África, haciendo de la esclavitud una institución central en la economía colonial de la isla.

Precursores culturales taínos en las Antillas
Las raíces más profundas de la cultura taína se encuentran en la antigua tradición Coroso (4000 a. C.–100 d. C.), formada por pequeñas bandas de cazadores-recolectores cuyos asentamientos mayores, descubiertos recientemente, muestran un uso más complejo del paisaje. Hacia el 300 a. C., los saladoides —agricultores y alfareros llegados desde Sudamérica— fundaron grandes aldeas bien organizadas y produjeron cerámicas de alta calidad pintadas en blanco, naranja y rojo sobre fondos rojo oscuro, estableciendo la primera tradición agrícola y cerámica sostenida en Puerto Rico. Entre el 600 y el 1200 d. C., las culturas ostionoide y elenoide desarrollaron las primeras sociedades plenamente agrícolas en las Antillas, con asentamientos ribereños, nuevos centros ceremoniales, cerámicas ricamente pintadas y objetos religiosos vinculados a los rituales de cohoba.

Entre el 1200 y el 1500 d. C., las sociedades taínas surgieron como cacicazgos complejos en Borinquen (Puerto Rico), La Española y el oriente de Cuba, caracterizados por una elaborada vida ceremonial y un liderazgo estratificado. Dentro de esta secuencia más amplia, el Complejo Hueca en Hueca-Sorcé, en Vieques —identificado por Luis Chanlatte Baik e Yvonne Narganes Storde— representa una tradición cultural distinta que coexistió con otros grupos isleños, añadiendo aún más diversidad al mosaico de precursores taínos.

Esclavitud y rebelión taína en Puerto Rico
En 1510, los españoles impusieron un sistema que asignaba a los taínos a españoles individuales para realizar trabajos forzados, lo que desencadenó un gran levantamiento en 1511. Liderados por Agüeybaná el Bravo, sucesor de Agüeybaná I, y por Guarionex, los taínos incendiaron el asentamiento en el río Guaurabo (hoy río Añasco), matando a unas 80 personas, entre ellas Cristóbal de Sotomayor. Una leyenda popular afirma que primero ahogaron a un español llamado Salcedo para comprobar si los europeos eran inmortales, pero los historiadores no han encontrado pruebas de esta historia.

En marzo de 1511, Ponce de León lanzó un ataque nocturno contra varios caciques, matando a unos 200 taínos y esclavizando a muchos prisioneros. Agüeybaná persiguió a Ponce de León, pero fue asesinado por el arcabucero Juan de León en la batalla de Yahueca, lo que obligó a los taínos a retirarse. Esta derrota no puso fin al conflicto: siguieron más batallas, tras las cuales los grupos indígenas se retiraron gradualmente hacia el este mientras el control español y la esclavitud se expandían por toda la isla.

Esclavitud y el levantamiento taíno de 1511
En 1510 los españoles comenzaron a asignar grupos de personas indígenas a los colonos para realizar muchos tipos de trabajo. Esta explotación ayudó a desencadenar la rebelión taína de 1511, liderada por Agüeybaná el Bravo, sucesor de Agüeybaná I, junto con Guarionex. Los rebeldes incendiaron el asentamiento en el río Guaurabo (hoy río Añasco) y mataron a unas 80 personas, entre ellas Cristóbal de Sotomayor.

Según una leyenda popular pero no documentada, antes del levantamiento los taínos ahogaron a un español llamado Salcedo en el río Guaurabo y vigilaron su cuerpo durante tres días para demostrar que los europeos eran mortales. En marzo de 1511, Ponce de León lanzó un ataque nocturno contra varios caciques, matando a unos 200 combatientes indígenas y esclavizando a muchos prisioneros. Agüeybaná fue asesinado por el arcabucero Juan de León en la batalla de Yahueca, tras lo cual los taínos se retiraron. Aun así, esta primera derrota no puso fin al conflicto, que continuó con nuevas batallas antes de que las fuerzas indígenas se replegaran hacia el este.

División colonial de Puerto Rico y primeros trabajos esclavizados
En 1514, la Corona española dividió Puerto Rico en dos distritos administrativos: el Partido de San Juan (Puerto Rico) en el este y el Partido de San Germán en el oeste, separados por una línea que iba desde el río Camuy en el norte hasta el río Jacaguas en el sur (Ponce y Juana Díaz). A lo largo de los siglos XVIII y comienzos del XIX, San Germán se subdividió en numerosos pueblos, entre ellos Aguada (1692), Añasco (1733), Mayagüez (1760), San Sebastián y Ponce (1752), Rincón (1770), Cabo Rojo (1771), Moca (1774), Aguadilla (1780), Peñuelas (1793), Camuy (1807), Sabana Grande (1814), Isabela (1819), Quebradillas (1823), Lares (1827), Guayanilla (1833) y, más tarde, Las Marías, Maricao, Hormigueros, Guánica y Lajas a finales del siglo XIX. Algunas de estas comunidades posteriormente se fusionaron, se dividieron y finalmente se convirtieron en municipios separados, como en el caso de Guánica, que reapareció como municipio independiente en 1914.

A medida que las poblaciones indígenas disminuían, en gran parte debido a epidemias, los españoles comenzaron a traer africanos esclavizados —hombres, mujeres y niños— para trabajar la tierra. La autorización real bajo la Corona española formalizó este cambio, haciendo de la esclavitud africana un componente central de la economía colonial de Puerto Rico.

Precursores taínos en las Antillas
La tradición Coroso (c. 4000 a. C.–100 a. C.) fue una cultura arcaica de cazadores-recolectores organizada en pequeñas bandas, con evidencia reciente de algunos asentamientos más grandes. La cultura saladoide (c. 300 a. C.–600 d. C.) trajo desde Sudamérica a Puerto Rico la primera sociedad agrícola y alfarera, con asentamientos grandes y bien organizados y finas cerámicas pintadas en blanco, naranja y rojo sobre fondos rojo oscuro.

Desde c. 600–1200, los grupos ostionoides y helenoides formaron las primeras sociedades agrícolas en Puerto Rico, asentándose cerca de los ríos, fundando nuevos centros ceremoniales, produciendo cerámicas oscuras pintadas en blanco, naranja o rojo y elaborando objetos religiosos vinculados al cohoba. Hacia c. 1200–1500, los cacicazgos taínos en Borinquen, La Española y el oriente de Cuba desarrollaron complejas estructuras de liderazgo y sistemas ceremoniales altamente elaborados. El Complejo Hueca, identificado en el sitio Hueca–Sorcé en Vieques por Luis Chanlatte Baik e Yvonne Narganes Storde, representa una tradición cultural distinta que coexistió con otros grupos en la isla.